Validasi Penambatan Molekuler (Docking) (Zingiber Officinale) dan (Cymbopogon citratus) Sebagai Ligan Aktif Reseptor PparÎ³

Okta Nursanti; Isna Wardani; Ginayanti Hadisoebroto

doi:10.52689/higea.v14i1.469

Validasi Penambatan Molekuler (Docking) (Zingiber Officinale) dan (Cymbopogon citratus) Sebagai Ligan Aktif Reseptor PparÎ³

Okta Nursanti, Isna Wardani, Ginayanti Hadisoebroto

Sari

Jahe dan sereh merupakan tanaman yang berkhasiat salah satunya yaitu sebagai anti diabetes tipe 2, senyawa jahe dan sereh yang berkhasiat sebagai antidiabetes antara lain cineol, farnesol, geraniol, linalool, limonen, pinen, terpineol dan zingeron. Tujuan dari penelitian ini adalah identifiikasi senyawa metabolit sekunder yang mempunyai aktivitas anti diabetes yang aman serta melihat interaksi asam amino yang terbentuk antara molekul senyawa dari tanaman jahe dan sereh dengan sisi aktif protein PPARÎ³Â hasil penambatan molekul. Penelitian ini dilakukan dengan metode insilico. Untuk pencarian ligan uji menggunakanÂ ChEBI,Â pencarian struktur reseptor menggunakanÂ Protein Data Bank,Â penambatan molekul menggunakan Arguslab dan visualisasi menggunakanÂ Discovery Studio.Â Dari hasil penelitian uji toksisitas, farmakokinetik ke delapan senyawa yang ada pada jahe dan sereh mempunyai aktivitas antidiabetes yang aman. Dari hasil molekular docking senyawa yang mempunyai skor binding energi lebih rendah dari ligan pembanding adalah cineol, farnesol, geraniol, linalool, limonen, pinen, terpineol maka dapat disimpulkan bahwa senyawa tersebut dapat bersaing untuk berikatan dengan reseptor PPARÎ³.

Kata Kunci

Jahe; Sereh; Arguslab; Discovery studio; Antidiabetes

Teks Lengkap:

PDF

Referensi

Anastas, P.T & Warner J.C. , (1998). Green Chemistry : Theory and Practices, New York : OxfordUniversity Press.

DiPiro JT, Chisholm-Burns MA, Wells BG, Schwinghammer TL, Malone PM, Kolesar JM. (2013). Pharmacotherapy principles and practice third edition, McGraw-Hill Education, San Francisco, 758.

DiPiro JT, Wells BG, Schwinghammer TL, DiPiro CV. (2015). Pharmacotherapy handbook ninth edition, McGraw-Hill Education, San Francisco, 161-164.

International Diabetes Federation. (2017). IDF diabetes atlas 8th edition, International Diabetes Federation, Brussels, 16-20, 43-46, 124-125.

In J.B. Taylor & D.J. Triggle (Ed6.), Comprehensive Medicinal Chemistry II volume 4: Computer-Assisted Drug Design. Elsevier.

Kementerian Kesehatan RI, 2014, Situasi dan analisis diabetes, Pusat Data dan Informasi, Jakarta.

Li, H.. et al. (2000). HypoGen: an automated system for generating 3D predictive pharmacophore models. In In Pharmacophore Perception, Development, and Use in Drug Design. International University Line, pp. 171–189.

Ling C, G.L., (2009). Epigenetics: a molecular link between environmental factors and type 2 diabetes. Diabetes, (58), pp.2718–2725.

Ling, C. et al., (2008). Epigenetic regulation of PPARGC1A in human type 2 diabetic islets and effect on insulin secretion. Diabetologia, (51), pp.615–622.

Liu L, Li Y, T.T., 2008. Gene-environment interactions and epigenetic basis of human diseases. Curr Issues Mol Biol, (10), pp.25–36.

LÃ³pez-Candales A., (2001). Metabolic syndrome X: a comprehensive review of the pathophysiology and recommended therapy. J Med, (32), pp.283–300.

Mirghani, M.E.S., Liyana, Y., Parveen, J., )2012).Bioactivity analysis of Lemongras (Cymbopogan citratus) essential oil. International Food Research Journal.

Motiejunas, D., & Wade, R. )2006). Structural, Energetics, and Dynamic Aspects of Ligand-Receptor Interactions.

DOI: http://dx.doi.org/10.52689/higea.v14i1.469

Refbacks

Saat ini tidak ada refbacks.

Karya ini dilisensikan di bawah Lisensi Internasional Creative Commons Atribusi-NonKomersial-BerbagiSerupa 4.0.